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USB-HDD 　　硬盘仿真模式，DOS启动后显示C:盘，HP U盘格式化工具制作的U盘即采用此启动模式。此模式兼容性很高，但对于一些只支持USB-ZIP模式的电脑则无法启动。 　　

USB-HDD+ 　　增强的USB-HDD模式，DOS启动后显示C:盘，兼容性高于USB-HDD模式。但对仅支持USB-ZIP的电脑无法启动。 　　

USB-ZIP 　　USB-ZIP（大软盘模式）： 启动后U盘的盘符是A； 　　USB-ZIP大容量软盘仿真模式，此模式在一些比较老的电脑上是唯一可选的模式，但对大部分新电脑来说兼容性不好，特别是2GB以上的大容量U盘。FlashBoot制作的USB-ZIP启动U盘即采用此模式。 　　

USB-ZIP+ 　　增强的USB-ZIP模式，支持USB-HDD/USB-ZIP双模式启动(根据电脑的不同，有些BIOS在DOS启动后可能显示C:盘，有些BIOS在DOS启动后可能显示A:盘)，从而达到很高的兼容性。其缺点在于有些支持USB-HDD的电脑会将此模式的U盘认为是USB-ZIP来启动，从而导致4GB以上大容量U盘的兼容性有所降低。 　　

USB-CDROM 　　光盘仿真模式，DOS启动后可以不占盘符，兼容性一般。其优点在于可以像光盘一样进行XP/2003安装。制作时一般需要具体U盘型号/批号所对应的量产工具来制作，对于U3盘网上有通用的量产工具。